Mở rộng hoạt động ra Trung Quốc

Sau nhóm nhỏ Super Junior-K.R.Y và Super Junior-T, vào ngày 2 tháng 10, 2007, S.M. Entertainment thông báo một nhóm nhỏ nữa của Super Junior sắp ra đời và sẽ hoạt động tại Trung Quốc từ năm 2008. Zhoumi và một học viên người Canada gốc Hoa của S.M. Entertainment là Henry Lau, người đã từng xuất hiện trong MV "Don't Don", sẽ là hai thành viên của nhóm nhỏ này.[132]

Thông báo đã gây nên một làn sóng phản đối mạnh mẽ và sự bất bình từ fan của Super Junior về hai thành viên mới. Lúc đầu, các fan đã định tẩy chay hết sản phẩm của công ty, nhưng sau đó họ đã nhất trí cho một cuộc biểu tình trong im lặng thay thế. Hàng ngàn fan từ fanclub chính thức E.L.F của Super Junior đã âm thầm ngồi trước tòa nhà SM và mang theo những biểu tượng để ủng hộ việc nhóm chỉ có 13 thành viên.[133]

Sau nhiều tin đồn xung quanh việc thêm thành viên vào nhóm, các fan đã quyết định tìm tiếng nói trong công ty nhờ vào việc trở thành cổ đông của S.M. Entertainment. Vào ngày 20 tháng 3, 2008, các fan của Super Junior đã mua 58,206 cổ phiếu của S.M. Entertainment, nắm giữ 0.3% cổ phần của công ty.[134] Họ đã tuyên bố rằng sẽ làm mọi cách để có thể chống lại việc SM thêm thành viên vào nhóm, giữ vững con số 13 thành viên của Super Junior.[134]

Xung đột với MBC

Đã có một cuộc tranh cãi giữa S.M. Entertainment và đài MBC khi SM muốn Kangin tham gia chương trình Explorers of the Human Body (Khám phá cơ thể người) của đài SBS thay vì chương trình Sunday Night Dong-An Club (동안클럽) của MBC mà Kangin đang tham gia dẫn chương trình. MBC sau đó đã tạm thời ngừng phát sóng tất cả các màn trình diễn hay chương trình có sự tham gia của Super Junior tại MBC.[135] Kangin cũng đánh mất vị trí MC vào tay T.O.P của Big Bang tại chương trình âm nhạc Show! Music Core và tại hai chương trình tạp kĩ khác mà sau đó đã phải ngưng lại do tỉ suất xem thấp sau khi Kangin rời khỏi.[136] MBC đã yêu cầu một lời xin lỗi từ S.M. Entertainment để lại có thể đưa Super Junior xuất hiện trở lại trên các chương trình của kênh này. Tuy nhiên, MBC cũng đã nói rõ rằng việc cấm Super Junior xuất hiện chưa bao giờ được tuyên bố một cách chính thức, mà chỉ là quyết định của các nhà sản xuất của các chương trình đó mà thôi.[137]

Han Geng kiện công ty và rời nhóm

Vào ngày 21 tháng 12, 2009, Han Geng đã đệ đơn xin chấm dứt hợp đồng với S.M. Entertainment, công ty quản lý của nhóm. Ngày tiếp sau đó, luật sư của Han Geng đã công bố nguyên nhân cho sự việc trên: Những điều khoản trong hợp đồng là có lợi cho SM, thời gian hợp đồng hoàn toàn không hợp lý khi dài tới 13 năm, khoản tiền kết thúc hợp đồng là quá lớn, không được quyền bàn lại về hợp đồng, bị bắt phải làm những việc không được nêu trong hợp đồng, bị bắt làm những việc trái ý muốn, bị phạt nếu không nghe theo công ty hoặc không tham gia một sự kiện nào đó hay thậm chí chỉ là đến muộn, và cuối cùng là việc phân chia lợi nhuận không đồng đều. Thêm vào đó, công ty đã bắt anh làm việc suốt và chỉ có một ngày nghỉ trong suốt hai năm, do đó mà bệnh viêm dạ dày và bệnh thận của anh cũng trở nên trầm trọng hơn.[138]

Quản lý hiện tại của Han Geng, Tôn Lạc (Sun Le), cũng đệ trình lên tòa án Hàn Quốc rằng S.M. Entertainment còn vi phạm một số quyền của Han Geng.[139] Nội dung bản đệ trình của Tôn Lạc bao gồm: Han Geng bị bắt phải mang mặt nạ do cách xử lý không tốt của công ty với vấn đề visa của anh, công ty cố ý chia cắt anh và gia đình, công ty từ chối lắng nghe hoặc phản bác các đề nghị của anh, công ty cố ý từ chối các hoạt động cá nhân cho Han Geng (trong đó có việc xuất hiện trong MV Fireflies của của Lâm Y Thần, mà sau đó đã có sự tham gia của Siwon và Donghae), và công ty cũng kiềm chế cả tiềm năng hoạt động quảng cáo của Han Geng.[140]

Vào ngày 21 tháng 12, 2010, Tòa án tối cao thành phố Seoul đã có một tuyên bố có lợi cho Han Geng. Tòa nói, "Cả 3 bản hợp đồng, trong đó có bản hợp đồng tháng 1 năm 2003, bản hợp đồng thay thế từ tháng 2 năm 2007, và bản hợp đồng bổ sung vào tháng 12 năm 2007 - tất cả đều vô hiệu lực". Một đại diện của SM Entertainment nói rằng rằng họ sẽ nộp đơn khiếu nại để đảo ngược quyết định của tòa.

Vào 27 tháng 9, 2011, Han Geng chính thức tách khỏi Super Junior sau khi đại diện của cả hai bên đã tuyên bố: "Han Geng và S.M. Entertainment đã có một bản thỏa thuận hữu nghị với nhau, và vụ kiện sẽ kết thúc sau khi Han Geng thông báo sẽ rút lại đơn kiện".[141][142][143]

Tranh cãi trong Expo 2010

Vào ngày 26 tháng 5, 2010, rất nhiều ngôi sao Hàn Quốc trong đó có Super Junior đã được mời đến tham dự sự kiện "Đêm hội nhạc pop và nhạc cổ điển Hàn Quốc" nằm trong khuôn khổ EXPO 2010 sẽ diễn ra tại Trung tâm hội chợ triển lãm văn hóa Thượng Hải vào ngày 30 tháng 5. Vì vé không được bán công khai, những người muốn tham dự show này chỉ có thể kiếm được vé từ ban tổ chức ở cửa phía tây của trung tâm hội chợ triển lãm vào ngày 30 tháng 5. Tổng số vé phát ra là 5000 vé, trong đó 2500 vé sẽ được phát miễn phí cho du khách Hàn Quốc trong khi con số thực tế lớn hơn 2500 người rất nhiều. Các fan của Super Junior ai cũng muốn được vào bên trong trung tâm, và cuối cùng nảy sinh xô xát và dẫn đến cả thương vong. Một cảnh sát địa phương đã bày tỏ rằng đó là lần đầu tiên anh được thấy sự hâm mộ điên cuồng đến vậy tại EXPO 2010 kể từ khi hội chợ này bắt đầu được mở ra.[144][145] Các anti-fan đã qui rằng chính Super Junior gây nên tình trạng đó, và phải chịu hoàn toàn trách nhiệm. Vì bên phía công ty của Super Junior không có động tĩnh gì, nên chỉ trong vòng vài ngày sau, toàn bộ trang chủ của Super Junior tại Hàn Quốc, trang web cá nhân của các thành viên, trang Baidu tại Trung Quốc của nhóm và baidu riêng của tất cả các thành viên đều bị hacker tấn công. Vấn đề còn kéo dài đến nhiều tuần sau đó mới lắng xuống.